目前已知可以培育的花卉主要包括绣球、百合、花菱草、鸢尾和菊花五大类。开启这个玩法需要你的等级达到要求，并修复家园第二个岛上的花圃。合成操作本身并不复杂，只需要将两朵花放入培育台，但每次都会消耗一根取粉笔，并且合成出新花色的概率充满了随机性，即使配方相同也可能得到不同的结果，这正是育种玩法的魅力所在。
绣球的初始颜色是红色和白色，通过合成可以培育出绿色这种普通品种，以及紫色、蓝色和粉色这些较为稀有的花色。具体的合成路线不少，比如红色绣球加白色绣球有可能产出绿色或紫色，而两朵白色绣球相合或者紫色绣球加白色绣球则有机会得到梦幻的蓝色绣球。百合的初始选择更多样，有白色、黄色和红色，它的合成系统也相对复杂，普通合成色包括绿色、橘色、紫色和橘粉色，而橘黄色、蓝色和粉色则属于稀有品种。想要粉色百合可以尝试白色加红色的组合，而橘黄色百合则可以通过黄色加紫色等配方来培育。
花菱草起始于红色和白色，它的普通合成色有绿色、黄色、粉色、橘色和橘红色，而浅粉色、紫色和蓝色则属于稀有范畴。如果你心心念念想合成出紫色的花菱草，可以尝试用两朵浅粉色的花菱草组合，或者用浅粉色加红色也有机会。鸢尾花的初始颜色是白色和紫色，通过合成可以获得蓝色的普通品种，而粉白色、绿白色和橘黄色则是更为难得的稀有花色。将粉白色鸢尾与紫色鸢尾结合，或者用两朵紫色鸢尾配对，都有可能培育出橘黄色的品种。
菊花的配色体系非常丰富，拥有多达十种颜色。它的合成规律也自成一体，比如蓝色菊花可以通过两朵黄色菊花合成，而粉白色的菊花则可能需要粉色与黄色组合。像紫色这类高级花色，其合成配方往往需要已经合成出的中间色作为材料，例如用粉白色加粉红色来尝试获得。一些基础的菊花颜色可以直接在花铺通过提升好感度来购买。
